歐亞專線S碼和M碼的主要區別在于尺寸和重量限制，以及相應的運費價格。

1. 尺寸限制：S碼和M碼的尺寸限制不同，S碼適用于較小的包裹，而M碼適用于稍大一些的包裹。具體的尺寸限制可以參考歐亞專線的官方網站或咨詢客服人員。

2. 重量限制：除了尺寸限制外，S碼和M碼還有不同的重量限制。S碼通常適用于輕量級的包裹，而M碼則可以承受更重的重量。在選擇合適的尺碼時，需要考慮到包裹的實際重量。

3. 運費價格：由于尺寸和重量限制的不同，S碼和M碼的運費價格也會有所差異。一般來說，M碼的運費會相對較高，因為它可以承受更大的尺寸和重量。在選擇尺碼時，需要根據預算和實際需求進行權衡。