車輛過戶協議書和買賣合同存在多方面區別。從概念內涵與適用范圍講，買賣合同聚焦車輛買賣行為約定，適用于買賣方式轉移所有權場景，過戶協議書范疇更廣泛，適用于多種導致車輛所有權變動情形。在內容側重點上，買賣合同著重車輛買賣相關條款，過戶協議書除基本內容外還涉及特殊情況處理及過戶具體條款。法律適用及效力也不同，買賣合同依據《民法典》中相關規定成立即生效，過戶協議書涉及所有權轉移一般需完成法定登記手續才生效 。

在合同主體方面，車輛買賣合同的主體通常就是買賣雙方，關系較為明確單純。但過戶協議書的主體范圍更為寬泛，除了常規買賣雙方外，還可能涵蓋因繼承、贈與等特殊原因致使車輛所有權發生轉移的情況。比如，車輛作為遺產由繼承人繼承，此時簽訂的過戶協議書主體就不是普通買賣關系中的雙方。

從手續及稅費角度來看，車輛買賣合同按照正常的交易流程辦理過戶、繳稅等手續，各項流程和標準都有明確規范。而過戶協議書涉及的情況多樣，其他轉讓形式在手續和稅費繳納上可能存在不同。像贈與方式的車輛過戶，在手續辦理上就和普通買賣有所差異，稅費的繳納情況也不相同。

從合同目的分析，車輛買賣合同的核心目的是達成車輛的買賣交易，實現商品與貨幣的交換。而過戶協議書的主要目的是確保車輛所有權合法順利地轉移到新的所有者名下，更側重于所有權變更這一結果。

總結來說，車輛過戶協議書和買賣合同在多個維度存在明顯差異。無論是概念內涵、適用范圍，還是內容側重點、合同主體、手續稅費以及合同目的等方面，都各有特點。在進行車輛相關交易時，當事人需依據具體情況，準確選擇合適的文書來保障自身權益和確保交易的合法性、順利性 。