自動油水分離器常見故障有：

自動除渣機停轉，可能是螺旋葉片被雜物卡死，需斷電后取出雜物；也可能是減速機故障，要拆電機后風扇蓋，若手轉動風扇電機轉動螺桿不轉，就更換減速機；還可能是過載保護，清理垃圾后復位熱繼電器。

排出渣物含水高，除渣口跑水，原因有除渣機網孔堵塞，需沖刷過濾網去除雜物；螺旋葉片毛刷條磨損，得更換毛刷條；除渣機停止轉動，要檢查電控系統工作時間、系統時鐘是否準確及除渣機故障；進水箱堵塞，要按操作手冊要求定期排污。

排水區域有油污，可能是電動排油閥故障，要檢查維修排油閥的執行器；排油不徹底，設備停運時進行一次或多次手控排油；分離箱沉淀污泥過多，按操作手冊要求定期排污泵故障。

潛污泵不運轉或不停止，泵故障就維修污水提升泵；液位浮球損壞，檢查更換液位浮球并監控面板輸入信號；熱繼電器保護，查看是否缺相，按熱繼電器復位鍵；控制器故障，看手動操作是否有效；泵運轉不出水，檢查是否反轉、是否堵塞、管道是否通暢、止回閥是否安裝錯誤。

加熱狀態異常，溫控儀設定絮亂就調整設定；溫控探頭損壞就更換；加熱棒損壞就更換；加熱冒煙就清理油脂。

控制面板不亮是控制板故障，檢查DC24V電源電壓是否不足。

積炭，如果油水分離器損壞，柴油中的水及雜質會在進氣門、進氣道、汽缸內淤積形成積炭，影響發動機工作。

發動機冒白煙，因為燃油中的水分燃燒變成水蒸氣。發動機還會加速無力、不穩定及排放黑煙，因為噴油嘴會被磨損拉傷甚至卡死。

不進水可能是進水管堵塞，要檢查進水管；也可能是進水閥門沒打開，打開閥門就行。

不出油可能是液位較低，無需處理；或是油路堵塞，要疏通管道；刮油板與水面不平行或刮油板破損變形，調整或更換刮油板。

電機不轉且運轉指示燈亮，電機壞了就檢查更換；電機不轉且運轉指示燈不亮，過載保護器跳閘就調整電流，線路接觸不良就檢查線路或線頭是否松動。

水從溢流口出來，可能是進水量超過額定處理水量，降低入水量；也可能是排污泵不排水，檢查污水泵和線路。

出水流量不足或不出水，水泵損壞就維修；箱內淤泥量較大就沖刷箱體；通氣管堵塞就處理污物；轉速太低檢查電源電壓；抽送液體密度大或粘度高就改變。

設備有異響抖動，螺旋軸松動就檢查調整位置；水泵松動就檢查固定螺絲；水泵軸承損壞就維修；水泵反轉就調整線路；水泵安裝傾斜不正就重新安裝。

故障燈亮，水位過高就手動開啟水泵；油位過高就更換油桶；加熱系統失靈就更換。