新車在汽車檢測站的檢測流程包括以下幾個步驟：

1、車主將新車開至檢測站門口，并在等待檢測期間取下車內的貴重物品；

2、由專業檢測人員將新車上線進行檢測，車主需在等待區等待檢測結束并提車；

3、檢測結束后，工作人員會開具檢測單、收款條，并將保險單副本裝訂好交給車主；

4、車主在服務大廳繳納檢測費用，該費用涵蓋了汽車的各項檢測費和工本費；

5、車主將相關資料（包括檢測表、保險副本、行駛證和收據）交給工作人員，并在5分鐘后領取機動車檢驗合格標志，以及在行駛證副證上蓋章；

6、最后，車主需要領取環保標志。