針對電動三輪車電機進水的問題，以下是一些處理方法。

首先，不要給電動三輪車電池充電，而是將其放在通風處晾干。在電源接入前，用抹布或紙巾將電池和連接插口擦拭干凈，以防止電源短路，變速器、電機燒毀等危險問題的出現。

如果因為電動車進水導致電機進水，可以用吹風機將其吹干，并將其在陽光下曬干。

電動三輪車涉水行駛后，特別是水位較深的情況下，如果水位沒過中軸，而車子又有一定年齡的話，水就有可能進入電機內部。這個時候，需要將電機里的水放出來。此過程較繁瑣，建議去專業維修店解決。

如果控制器進水，可將控制器卸下，用吹風機吹干，之后再在陽光下曬干。另外，可以給控制器加一層保護膜，以提高其防水性能。